Кафедра дитячих інфекційних хвороб була створена у 1945/1946 навчальному році, після повернення Київського медичного інституту з евакуації та реорганізації медичного факультету. Короткий строк завідував кафедрою професор Ф.Д.Рум'янцев, а у 1946 р. на цю посаду був призначений доцент О.В.Черкасов. До створення кафедри викладання інфекційних хвороб у дітей проводилося на кафедрі педіатрії лікувального і санітарно-гігієнічного факультетів, а ще раніше (XIX ст.) лекції, присвячені найбільш розповсюдженим інфекційним захворюванням серед дітей, читали професори О.П.Матвеев, В.Є.Чернов, 1. В.Троїцький. О.В.Черкасов керував кафедрою до 1971 р. З 1971 до 1983 pp. (12 років) кафедру очолював професор П.С.Мощич; згодом його учениця Л.А.Трішкова (1983-1994), а з 1994 р. й донині кафедрою завідує професор С.О.Крамарєв.
У період становлення співробітники кафедри доклали багато зусиль у створенні навчально-методичного підґрунтя для викладання дисципліни. Під науковою редакцією професорів кафедри видано підручник для студентів "Інфекційні хвороби у дітей", який користується попитом не лише серед студентів, а й поміж практичних лікарів.
Основною науковою проблемою співробітників кафедри є дитячі інфекційні хвороби і боротьба з ними, вивчення структури дитячої інфекційної патології, актуальні питання вірусних гепатитів, кишкових інфекцій, методи діагностики, лікування і профілактики дифтерії та ін. Найвагоміші наукові досягнення впроваджені в практику охорони здоров'я. Наукова тема з кишкових інфекцій входила в міжнародну галузеву науково-технічну програму в Україні. Співробітниками кафедри розроблений спосіб лікування патологічних станів, які супроводжуються синдромом дифузного внутрішньосудинного згортування, отримані патенти та авторські свідоцтва на спосіб нормалізації гемостазу при ДВЗ-синдромі та його діагностики (С.О.Крамарєв, В.О.Дорошенко), на спосіб лікування вірусних гепатитів у дітей (професор Л.О.Тришкова), спосіб лікування дифтерії (С.О.Крамарєв, О.О.Воронов), антибіотикоре-зистентних форм сальмонельозу у дітей (О.В.Корбут), спосіб діагностики ротавірусної інфекції у дітей (Л.О.Палатна).
За останні роки на кафедрі дитячих інфекційних хвороб було видано 8 монографій, 14 методичних рекомендацій, інформаційних листів, отримано 8 авторських свідоцтв і патентів. Захищені 1 докторська, 8 кандидатських дисертацій.
Співробітники кафедри протягом багатьох років здійснюють практичне керівництво педіатричною та інфекційною службою в Україні. За час роботи кафедри професор О.В.Черкасов, а потім професор П.С.Мощич були головними педіатрами МОЗ України, понад 10 років доцент кафедри С.О.Богатирьова була головним спеціалістом МОЗ України з дитячої інфекційної патології. Сьогодні професор С.О.Крамарєв є головним дитячим інфекціоністом МОЗ України. Під його керівництвом проводяться конференції в містах та областях України з актуальних проблем дитячої інфекційної патології, видаються інструктивні та інформаційні листи. Співробітники кафедри дитячих інфекційних хвороб беруть участь у розробленні наказів та інструкцій МОЗ України, є консультантами державної екстреної медичної допомоги (санітарна авіація).